إدارة البحوث ورقابة الإصدارات هي واحدة من الوحدات التنظيمية التابعة للمدير التنفيذي للشؤون الإسلامية تم إقرارها ضمن الهيكل التنظيمي للهيئة العامة للشؤون الإسلامية والأوقاف بقرار من مجلس الوزراء رقم 22 لسنة 2009 م، ويتلخص دور إدارة البحوث ورقابة الإصدارات في الإشراف على إعداد الإصدارات والبحوث ونشرها والرقابة على الكتب والبحوث والدراسات الدينية.

وتتكون إدارة البحوث من قسمين: قسم البحوث وقسم مراقبة الإصدارات الدينية

قسم البحوث

مهمة قسم البحوث إعداد البحوث والدراسات العلمية المتنوعة وفق رؤية الهيئة ورسالتها في مجال البحث والإصدارات الدينية والوطنية والاجتماعية والعالمية التي تعتمد أساسا على النقاط التالية:

• التقيد بالخطة التشغيلية وتنفيذ مبادراتها
• الالتزام بمنهج الدين الإسلامي المتسم بالوسطية والاعتدال
• توخي منهج التيسير في الدين والبعد عن الغلو والتشدد
• الابتعاد عن الخلافات المذهبية والقضايا السياسية
• التقيد بخدمة المجتمع وأمن الوطن واستقراره والحفاظ على مكتسباته   

قسم رقابة الإصدارات الدينية

مهمة قسم رقابة الإصدارات الدينية الرقابة على المصاحف والكتب والإصدارات والمؤلفات والبحوث الصادرة عن الهيئة والواردة من داخل الدولة وخارجها، وفق المنهجية التالية:

• توخي النزاهة والعلمية في أداء الدور الرقابي
• حفظ الوثائق والمستندات الخاصة بالرقابة
• أرشفة الإصدارات المكتوبة والصوتية والمرئية التي تمت مراقبتها
• الأمانة والسرية التامة وعدم الإفصاح عن أي معلومة رقابية إلا للجهة المعنية
• رفع تقارير دورية عن أنشطته إلى مدير الإدارة
• إعداد تقارير عن المطبوعات والإصدارات التي يتم مراقبتها

الهدف الاستراتيجي لقسم البحوث ورقابة الإصدارات

لإسهام في تنمية الوعي بالثقافة الإسلامية وحماية المجتمع من التأثر بالأفكار الهدامة وذلك بإعداد كتب ومطويات وإصدارات سمعية ومرئية أو إلكترونية، وبرقابة الإصدارات الدينية بغرض تبصير الناس بحقائق الدين الإسلامي وقيمه الحضارية القائمة على الاعتدال والتسامح، وتعزيز منهج التسامح والحيلولة دون إنتشار الأفكار السلبية بين أفراد المجتمع.​